Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms