Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pkp3Q9QY23 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pkp3Q9QY23 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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