Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pcsk1nQ9QXV0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms