Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apbb1Q9QXJ1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb1Q9QXJ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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