Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms