Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Limd1Q9QXD8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms