Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms