Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms