Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln8Q9QUK3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms