Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms