Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms