Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkain4Q9JMG4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms