Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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