Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rabgef1Q9JM13 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms