Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Higd1aQ9JLR9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1aQ9JLR9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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