Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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SacsQ9JLC8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SacsQ9JLC8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms