Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin3Q9JLB9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms