Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scamp4Q9JKV5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms