Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole3Q9JKP7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole3Q9JKP7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole3Q9JKP7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole3Q9JKP7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole3Q9JKP7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole3Q9JKP7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole3Q9JKP7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole3Q9JKP7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole3Q9JKP7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms