Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms