Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms