Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.9 ms