Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms