Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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