Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfhx4Q9JJN2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms