Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms