Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lmbr1Q9JIT0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms