Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Praf2Q9JIG8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms