Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc22Q9JIG7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms