Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms