Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LratQ9JI60 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LratQ9JI60 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms