Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmod3Q9JHJ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms