Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MesdQ9ERE7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MesdQ9ERE7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms