Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParvgQ9ERD8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParvgQ9ERD8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms