Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfip11Q9ERA6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfip11Q9ERA6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms