Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms