Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms