Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp3a44Q9EQW4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms