Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf1Q9EPU4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf1Q9EPU4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms