Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r172Q9EPS4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r172Q9EPS4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms