Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1aQ9EPL5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms