Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms