Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r53Q9EP93 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms