Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms