Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms