Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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