Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxp4Q9DBY0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms