Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr53Q9DB94 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr53Q9DB94 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms