Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms