Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn3Q9DAW9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms